虽然卫生部已经喊了很多取消“以药补医”的口号，但是在实行上还是有很大的难处。因此，最近商务通过一份调研后，认为，要彻底取消以药补医，最好的方法就是医院和药房分离。

　　3月中，商务部向国务院呈交了一份调研报告，指向“以药养医”的医疗制度痼疾，请缨参与改革，并阐述了其参与医改的计划与实施路径。 报告调研了北京、上海等地零售药店情况，建议以北京、上海等地作为试点，关闭社区卫生服务中心药房，允许患者凭处方到社会连锁药店自行购药。

　　事实上，早在2007年，中共十七大报告已明确提出，医改方向要实现四个分开，即“政事分开、管办分开、医药分开、营利性和非营利性分开”。其中医药分开被看作切断以药养医的重要切入点。然而，新一轮医改启动至今已有三年，医药分开的推进始终阻力重重。

　　一些城市尝试在医疗机构内部将行医和卖药分开。如南京通过药房“托管”的形式实现医药分家，试图以此遏制医生为收取药品回扣开大处方的行为;芜湖作为首批医药分开的试点，一度将市属八家公立医院的药剂科划归新成立的“药品管理中心”，将医与药分别核算管理。

　　业界专家指出，上述模式并不治本。要杜绝“以药养医”，须将医院药房彻底剥离，实施“医药分业”，即推动二者彻底分化为两个不同的行业，让医生无法通过开方获取药商的回扣。

　　零售药店从中看到了巨大的市场。2010年起接管药品流通行业管理工作的商务部，也由此成为力主推动医药分业的主力军。

　　北京医保全新大药房总经理李庆福告诉财新记者：“药店是目前医疗体系中非常边缘的一个环节。商务部作为药店流通行业的主管部门，一直都在寻找机会，让医药商业终端做大做强。”