支付方式改革或许治愈以药养医的毒瘤，但是在实行支付方式改革之后，一些新问题会随之暴露出来。缺乏科学并评估，设计草率的医保制度有可能阻碍支付方式改革的推进。

　　在上海的一家三甲专科医院，每个月的最初几天都会人满为患，来配药的病人挤满了医院。“有些紧俏药品，月头2、3号就配不到了”，该院医保办的一位工作人员说。

　　形成如此“壮观”景象的原因在于，一些价格高昂的药品进入了医保目录，甚至基本药物目录。这些贵重药品的使用危及了医院的总量控制，以至于医院不得不限制或停止使用此类药品。上述专科医院医保办的一位工作人员说，“有些药我们(的医保支付总量)吃不下，纳进来，盘子就会崩掉。国家为什么把这个药纳进去?也没有做经济学评估。人社部也没来过我们医院调研。”这位工作人员将由于进入医保目录，而造成的配药难列为他工作中的第一大难题，排在医院推诿病人之上。

　　“现在有很多声音质疑，医保目录过大，尤其是在国家层面。”上海市卫生局的一位副处长说，“目录那么大，总额又这么小”，医院没有办法，“我不进这个药，我不进总可以吧。”

　　“(人社局的态度是)你别跟我说你不够，超了我罚你”。“矛盾哗哗~地一下子全出来了”，上述专科医院医保办工作人员说。

　　复旦大学医院管理研究所所长高解春认为，基本医疗保险应该明确“何谓基本”，现实中，基本医疗保障制度之“基本”往往被曲解为低水平和低价格，而不是财政投入力所能及范围内，民众缺之不可，迫切需要的保障和服务。

　　中国人民大学医改研究中心主任王虎峰认为，应该“科学地对药品和技术的准入进行评估”。而当前制定医保目录的过程中，缺乏科学的评估，“成本效益很差的药品和检查方法(进入医保目录)无形中极大地浪费了医疗资源”，“每样东西必须算笔账，考虑性价比。”

　　钱小山则认为，一方面，医疗保险应该主要集中于个人和家庭无法承受的疾病风险。但此轮医改的医保政策带有过多福利的色彩，“福利用医保支付，不符合保险学互助共济的原理，给基金造成了浪费。”

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　　假设‘医保付费’和‘以药养医’两个毒瘤都已经割去了，也只能是限制了医院和医生的收入，我国公立医院数量世界第一，公立体制漏洞无数，政府投资永远不足，医院如何生存?去了‘以药养医’，肯定还会出现‘以红包养医’、‘以过量检查养医’、‘以****养医’，永无休止，医院有的是办法让患者多掏钱!所以，‘体制’这颗大毒瘤精心保留着，你割去多少毒瘤都没用!‘垄断式医疗市场’不除，医改就是世纪大折腾!慢慢改吧!10年?20年?50年?100年?

　　当然，也有一种方式是我们可以不用设置年限的，就是政府文批立即实行，只要政府一做出批示，我国没有办不成的事情，2011年上半年温总理不是叫我们加快保障房建设，要保证上半年竣工多少，然而上半年过去一个月连栋保障房都没有，结果政府一怒之下，批示各省谁在年底前完不成制定任务就滚回家种田，结果保障房忽然一夜之间百花开似的，整个大江南北一片热火朝天。所以说，去除以药养医的毒瘤不是我们说了算，而是政府，只要政府下定决心，没有办不成的事情，不过，我们的政府现在有精力来管理这方面的事情吗?